A lizin-kiegészítők szedése nagyon biztonságos, és úgy tűnik, hogy nem okoz sok mellékhatást. A legtöbb ember akár napi 3 gramm (g) lizin adagot is bevehet mellékhatások nélkül.

A lizin adagjának napi 10-15 g-ra való emelése emésztési problémákat okozhat, mint például:

• hasmenés
• hányinger
• gyomorgörcsök

Vannak jelentések a lizin-kiegészítők és a veseproblémák közötti összefüggésről, és állatokon végzett vizsgálatok arra utalnak, hogy a lizin-kiegészítők növelhetik az epekő és a magasabb koleszterinszint kockázatát.